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Manual Básico de Estatística Médica com a Linguagem R

Introdução à análise de dados com a linguagem R e o RStudio

Manual básico de uso da linguagem estatística R no RStudio.

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Manual desenvolvido como texto de apoio para aulas de Metodologia Científica 2 (MEP2) do curso de Medicina do UNIPTAN. A disciplina MEP2 aborda o tema Bioestatística e usa o RStudio e a linguagem R em suas aulas práticas.

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Henrique Alvarenga da Silva

Médico Psiquiatra, com graduação em Medicina pela Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG - 1997) e especialização em Psiquiatria pelo Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG - 2000) e especialização em Psiquiatria da Infância e Adolescência na FHEMIG (2001). Especialista em Psicoterapia Cognitiva-Construtivista. Bacharel em Direito pelo Instituto de Ensino Superior Tancredo de Almeida Neves (IPTAN). Professor do Curso de Medicina do UNIPTAN na disciplina de Métodos de Estudo e Pesquisa 2, com enfase em Bioestatística e Epidemiologia Médica. Professor de Psiquiatria do Curso de Medicina da Universidade Federal de Minas Gerais. Tem experiência nas área Psiquiatria e em Neurociências, com ênfase na interface entre a ciência, tecnologia, filosofia, comportamento e emoção.

Contents

Table of Contents

Dedicatória

Capa

Prefácio

Introdução

R - uma linguagem para análise de dados e gráficos

A importância da Estatística na Medicina

Breve História do R

  1. Timeline
  2. Comprehensive R Archive Network, CRAN.
  3. Popularidade do R
  4. RStudio
  5. Referências.

Instalação do R e do RStudio

  1. Instalando o R
  2. Instalando o RStudio
  3. Video da instalação no Youtube

RStudio - primeiros passos

  1. Os Painéis do RStudio
  2. R Script
  3. R Notebook

Variáveis no R

  1. Objetos no R
  2. Variáveis no R
  3. Vetores no R

Tipos de Dados

  1. Variáveis categóricas (qualitativas)
  2. Variáveis quantitativas (numéricas)
  3. Variáveis Lógicas
  4. NA Values

Funções no R

Pacotes do R

Data Frames

  1. O Operador $

Lendo Dados

RStudio Projects

  1. Working Directory
  2. Projects do RStudio

Estatística Descritiva no R

  1. Introdução
  2. Parte 1 - Carregamento do dataset mpg
  3. Parte 2 - Tabelas de frequências
  4. Parte 3 - Medidas de Tendência Central
  5. Parte 4 - Medidas de Dispersão

Manipulando dados no R

  1. O conjunto de pacotes tidyverse
  2. O pacote dplyr
  3. A função `filter()
  4. A função select()

Visualizando dados - Gráficos básicos do R

  1. Introdução
  2. Parte 1 - Visualizando dados categóricos.
  3. Gráficos de Pizza - picharts
  4. Parte 2 - Visualizando dados numéricos
  5. Histogramas
  6. Gráficos de densidade
  7. Boxplots
  8. Parte 3 - Visualizando relações entre variáveis
  9. Correlação entre uma variável numérica e uma variável categórica
  10. Correlação entre duas variáveis numéricas

Correlação

  1. Introdução.
  2. Análise Univariada e Bivariada
  3. Um scatter plot histórico
  4. Covariância
  5. Coeficiente de Correlação
  6. Calculando o coeficiente de correlação no R

Modelos Científicos

  1. Introdução
  2. O que é um modelo científico?
  3. Modelos de relação linear no R
  4. O Coeficiente de Determinação - magnitude do efeito
  5. As limitações e utilidades dos modelos

Distribuições de probabilidade

  1. Introdução
  2. A Distribuição uniforme e um jogo de dados
  3. A distribuição normal
  4. A curva normal padrão
  5. A normalização e os z-scores.
  6. Calculando as probabilidades - parte 1: pnorm(x)
  7. Os parâmetros da curva normal - média e desvio padrão
  8. Calculando as probabilidades - parte 2: pnorm(x, mean= , sd= )
  9. Calculando probabilidades parte 3 - a função qnorm()
  10. Simulando uma distribuição normal
  11. Verificando a normalidade.

População e amostra

  1. Distribuição amostral

Distribuição nula

Teste de Hipóteses

  1. Introdução
  2. A hipótese alternativa
  3. A hipótese nula
  4. Distribuição nula
  5. Nível de significância do teste
  6. Erros tipo I e tipo II
  7. Teste unicaudal ou bicaudal
  8. p-values

p-values

  1. Introdução
  2. Origens e confusões
  3. Interpretação gráfica do valor de p

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